El Golfo de California es una de las regiones mas diversas del Oceano Pacifico Oriental Tropical (OPOT) con alrededor de 822 especies de peces, 92 de ellas endemicas. La amplia biodiversidad en esta area ha permitido que se considere al Golfo de California como un centro de origen equivalente al de Centroamerica, ademas de que se encuentra entre los cinco ecosistemas marinos con mayor productividad biologica en el mundo. El presente trabajo tiene como objetivo determinar la composicion estructural y la diversidad taxonomica de los peces arrecifales y su relacion con factores ambientales en una zona costera de la bahia de La Paz (ZCBP) y de la Isla San Jose (ISJ), en el suroeste del Golfo de California. Para ello, se concretaron 12 campanas bimestrales de censos visuales: de marzo de 2001 a febrero de 2002 en la ISJ, y de abril de 2002 a marzo de 2003 en la ZCBP, para lo cual se realizaron transectos de 100 m de largo por 5 m de ancho en 8 localidades de la Isla San Jose y 8 en la costa oeste de la bahia de La Paz. Los censos se realizaron a una profundidad promedio de 5 metros.