El Rio Santa Cruz es una de las principales fuentes de abastecimiento de agua para las ciudades fronterizas de Nogales, Sonora, Mexico, y de Nogales Arizona, Estados Unidos de Norteamerica, conocidas como Ambos Nogales. La ubicacion de esta cuenca, ofrece la oportunidad de conocer y coadyuvar a la solucion de problemas transfronterizos, mediante la generacion de informacion basica. En terminos generales el agua superficial del Rio Santa Cruz es de buena calidad, ya que la mayoria de los parametros fisico-quimicos analizados no exceden los limites maximos permisibles senalados en los criterios ecologicos de calidad de agua para diferentes usos. Un total de 335 especies pertenecientes a 69 familias y 195 generos fueron identificadas en el cauce del RSC. Los principales factores que estan afectando la disponibilidad de agua en la cuenca del RSC son: el incremento en el numero de pozos y en el uso agricola y urbano, sequias, los desmontes para el cambio de uso de suelo, entre otros. De seguir esta tendencia, fuentes oficiales pronostican que se tiene asegurado el abasto de agua hasta el ano 2028 en la ciudad de Nogales, Sonora, Mexico."