En esta investigacion se utiliza el paquete de modelacion de acuiferos Modflow, en la cuenca del Rio San Pedro, Sonora, Mexico, teniendo como objetivo determinar el comportamiento hidrico de la cuenca, con la intencion de dar pautas para su optima utilizacion y manejo. Para lograr este objetivo se recabo informacion historica del area de estudio obtenida de instancias como CNA, INEGI, Compania Minera de Cananea, ademas de informacion generada ex profeso para el presente estudio. Esta ultima medicion consistio en 6 cuantificaciones trimestrales de flujo de agua superficial en cinco puntos, y nivel estatico en veinte pozos distribuidos a lo largo de la cuenca. Los resultados muestran que el acuifero se encuentra en equilibrio con tendencia en bajo grado a la perdida de volumen de agua acumulado, aclarando que no se estan tomando en cuenta los pozos explotados por la Compania Minera. Si se sigue explotando el acuifero de la manera actual, en lo que se refiere a cantidad de agua extraida, no se corre riesgo considerable riesgo de sobreexplotacion; sin embargo, si se requiere aumentar la extraccion, es necesario implementar sistemas de recarga artificial en las areas critica.