Les bioreacteurs a membranes (BAM) sont de plus en plus utilises dans le domaine du traitement des eaux residuaires urbaines notamment lorsque le terrain est limite ou qu'un traitement epuratoire pousse est requis. Neanmoins, la gestion de ces installations et notamment du colmatage des membranes reste difficile et constitue une source de problemes pour les exploitants. Ce travail s'interesse a la modelisation de ce procede ainsi qu'au phenomene de colmatage. Ainsi, trois installations reelles ont ete etudiees et l'une d'entre elles a ete choisie pour la calibration du modele ASM1, outil efficace et deja eprouve sur les procedes conventionnels. La methodologie a ete adaptee aux specificites des bioreacteurs a membranes et de l'installation modelisee en particulier. Un nouveau jeu de parametres de l'ASM1 a pu etre constitue. D'autre part, concernant la problematique du colmatage des membranes, le systeme "membrane/boues" a ete caracterise a travers l'etude des interactions entre les proprietes des boues, les conditions d'operation et les parametres de la filtration. Les deux BAM etudies ont montre des comportements assez differents confirmant la complexite de ces systemes.