De nombreuses esp ces montrent des variations cycliques de leurs densit s. Ces cycles ont un r le important dans l' mergence de zoonoses en augmentant les contacts entre l'Homme et l'animal. Suivant une approche d' cologie de la sant , j'ai tudi la communaut de parasites d'une communaut de rongeurs dynamique cyclique afin d'identifier les r servoirs d'agents de zoonoses et les parasites potentiellement impliqu s dans les cycles de cette communaut . Les r sultats et les suivis pizootiologiques r alis s en Franche-Comt permettent d'inf rer les facteurs de risques biotiques et abiotiques associ s l' mergence de ces zoonoses. Trois agents de zoonoses sont pr sents: deux hantavirus et le virus Cowpox. La dispersion et le comportement social des rongeurs sont importants pour la transmission de ces virus.