Cette th se s'inscrit dans le cadre de la mod lisation des ph nom nes naturels pour une instrumentation en un syst me de r alit virtuelle. La th se que nous d fendons porte sur trois id es principales: 1. la mod lisation traduit une praxis humaine. 2. les ph nom nes sont mod lis s en tant qu'entit s autonomes. 3. les interactions entre les entit s passent par un milieu qui est cr et fa onn par les entit s elles-m mes. Premi rement, la mod lisation est une activit humaine qui traduit implicitement et doit traduire explicitement une cause finale la mod lisation. Les ph nom nes mod lis s sont les affordances d'un utilisateur du mod le. Deuxi mement, l'autonomisation des mod les, consistant donner au mod le du ph nom ne naturel des capacit s de perception, d'action et d'adaptation, est une solution pragmatique efficace pour la mod lisation d'un syst me complexe. Troisi mement, en d l guant aux mod les la fabrication du milieu dont ils ont besoin pour d terminer leurs interactions, nous pouvons simuler dans un m me environnement virtuel des mod les li s des chelles tr s diff rentes les unes des autres, tout en respectant, par exemple, les lois de conservations en physique.