I vaccini inattivati sono usati principalmente in tutto il mondo per prevenire le infezioni da flavivirus. Attualmente, 6 vaccini contro l'encefalite da zecche prodotti dall'inattivazione in formalina del virus dell'encefalite da zecche (BTV) da fibroblasti di embrioni di pollo sono approvati in Russia. Non ci sono vaccini basati sul tipo siberiano di VEE, che domina nella maggior parte delle aree endemiche della Russia. La copertura media della popolazione delle regioni endemiche della Russia con la vaccinazione contro l'encefalite da zecche di circa il 5%. La lunga immunizzazione di tre volte e la necessit di rivaccinazione ogni 3 anni hanno spinto alla ricerca di nuovi modi di profilassi. L'immunizzazione genica dei topi con DNA plasmidico clonato con i geni prM, E e NS1 della VEE sotto il controllo dei promotori riconosciuti dalle RNA polimerasi eucariotiche ha fornito protezione solo contro un ceppo omologo del virus. I vaccini a DNA hanno dimostrato di essere instabili nelle cellule eucariotiche e capaci di integrarsi nei cromosomi cellulari. L'introduzione dell'RNA genomico virale completo, ma non dei geni E e NS1, ha portato anche alla protezione contro l'infezione virale. Batteri ricombinanti e peptidi antigenici multipli hanno indotto anticorpi virus-specifici.