L'endosymbiose archenne entrane une augmentation de la synthse des porphyrines, ce qui a pour effet de canaliser la glycine vers la synthse des porphyrines. Il n'y a pas de conversion de la glycine en srine qui est utilise pour la synthse de la cystathionine. L'homocystine est convertie en mthionine et inversement par la voie de la mthylation/dmthylation. Dans son mtabolisme en aval, l'homocystine se combine avec la srine pour gnrer la cystathionine, qui est ensuite mtabolise en cystine par la cystathioninase. Le manque de srine, d  une utilisation accrue pour la synthse des porphyrines, entrane un dfaut de synthse de la cystathionine et une accumulation d'homocystine produisant de l'homocystinemine. L'homocystine est convertie en mthionine. La mthionine donne des groupes mthyles pour la mthylation des amines biognes comme l'pinphrine, la norpinphrine, la dopamine et la srotonine ainsi que leurs mtabolites. Cela conduit  la gnration d'amines mthyles comme la 3,4-dimthoxyphnylthylamine, le LSD, la mescaline et la N-mthyltryptamine. Ces dernires sont gnres par N-mthylation et O-mthylation des amines biognes et sont hallucinognes, ce qui entrane des troubles de la conscience comme la schizophrnie, les troubles de l'humeur et l'autisme.