L'endosimbiosi arcaica porta ad un aumento della sintesi della porfirina con conseguente canalizzazione della glicina alla sintesi della porfirina. Non c' conversione della glicina in serina che  usata per la sintesi della cistationina. L'omocisteina viene convertita in metionina e viceversa attraverso la via della metilazione/demetilazione. L'omocisteina nel suo metabolismo in avanti si combina con la serina per generare cistationina che viene ulteriormente metabolizzata in cisteina dalla cistationinasi. La mancanza di serina dovuta a un maggiore utilizzo per la sintesi della porfirina porta a una sintesi difettosa della cistationina e all'accumulo di omocisteina che produce omocisteina. L'omocisteina viene convertita in metionina. La metionina dona gruppi metilici per la metilazione di ammine biogene come l'epinefrina, la norepinefrina, la dopamina e la serotonina e i loro metaboliti. Questo porta alla generazione di ammine metilate come la 3,4-dimetossifeniletilamina, LSD, mescalina e N-metiltriptamina. Queste sono generate dalla N-metilazione e O-metilazione delle ammine biogene e sono allucinogene, portando a disturbi della coscienza come la schizofrenia, i disturbi dell'umore e l'autismo.