A inibição da Na+-K+ ATPase pode provocar disfunção mitocondrial de várias formas. Como já foi referido, provoca a abertura do poro PT, o que leva ao colapso do gradiente de hidrogénio através da membrana interna e desacopla a cadeia respiratória. A diminuição da disponibilidade de magnésio em consequência do aumento do cálcio provoca uma produção defeituosa de ATP mitocondrial que afecta a ATP sintase. A disfunção mitocondrial resulta na redução incompleta de O2 e no aumento da produção do radical livre, o ião superóxido. O ião superóxido pode abrir o poro PT, completando o ciclo de destruição mitocondrial. A disfunção mitocondrial tem sido implicada na patogénese da degeneração neuronal, como a doença de Parkinson e o envelhecimento neuronal. Os danos causados pelos radicais livres têm sido implicados na oncogénese, na degeneração neuronal e no envelhecimento.