A gestão da qualidade é um conceito amplo que abrange tudo o que pode, individual ou coletivamente, influenciar a qualidade de um produto. Representa todas as medidas tomadas para garantir que os medicamentos tenham a qualidade exigida para o uso a que se destinam. A gestão da qualidade integra, portanto, boas práticas de fabricação. As boas práticas de fabricação aplicam-se às fases do ciclo de vida, desde a fabricação de medicamentos experimentais, transferência de tecnologia, fabricação comercial até a descontinuação do produto. No entanto, o sistema de qualidade farmacêutica pode estender-se à fase de desenvolvimento farmacêutico, o que, embora opcional, deverá facilitar a inovação e a melhoria contínua e reforçar a ligação entre o desenvolvimento farmacêutico e as atividades de produção. O porte e a complexidade das atividades da empresa devem ser levados em consideração no desenvolvimento de um novo sistema de qualidade farmacêutica ou na modificação do existente.