A alelopatia é um dos factores que contribuem para a formação e manutenção de florescências de cianobactérias e microalgas, que afectam fortemente os ecossistemas marinhos costeiros e causam problemas económicos à aquicultura. Além disso, algumas cianobactérias e microalgas produzem compostos nocivos que podem ter efeitos negativos nas plantas, nos animais e mesmo nos seres humanos. Nas últimas décadas, as águas costeiras do mundo registaram um aumento do número de eflorescências de algas nocivas. Além disso, foi descrito que as florescências de cianobactérias e microalgas estão a ocorrer em mais áreas do que nunca e, atualmente, este fenómeno é relatado regularmente. No entanto, apesar da gravidade do problema, os relatórios sobre a ocorrência e as consequências dos efeitos alelopáticos das cianobactérias e microalgas nos ecossistemas aquáticos são ainda insuficientes. Por conseguinte, é importante realizar um estudo mais intensivo deste fenómeno.