O objetivo do trabalho de investigação descrito neste livro foi desenvolver ferramentas moleculares que possam ajudar os clínicos a tomar decisões terapêuticas mais informadas em relação aos seus doentes infectados pelo VIH-1. Demonstrámos que a utilização da sequência parcial do gene p24 do VIH-1 pode funcionar como uma ferramenta para a subtipagem viral. Apresentamos um ensaio de carga viral do VIH-1 que é robusto, fiável, económico e eficaz em contextos de recursos limitados como a Índia. Através de um estudo extensivo que abrangeu 206 sequências do gene RT do VIH-1, foi desenvolvido e validado clinicamente um método eficaz e económico de genotipagem da resistência do VIH-1 aos medicamentos. Foi explorado um processo baseado na extensão de primers para verificar a sua capacidade de interrogar polimorfismos de nucleótido único clinicamente importantes no genoma do VIH-1, indicando assim o seu potencial para ser um sistema de deteção de mutações do VIH-1 económico, sensível e específico. Por último, descrevemos um ensaio de genotipagem do VHC, que tem potencial para influenciar as decisões terapêuticas em doentes co-infectados com VIH-1/VHC. O nosso trabalho acrescentará valor ao conjunto existente de ferramentas disponíveis para uma gestão inclusiva do VIH-1 que inclua o VHC como co-infeção.