La procalcitonina può essere utilizzata per differenziare l'infezione batterica da quella virale delle vie respiratorie e per determinare la durata del trattamento antibiotico, per la diagnosi e il monitoraggio di pazienti con sepsi e shock settico e per stimarne la prognosi, per monitorare la risposta al trattamento antibiotico, per rilevare le infezioni nei pazienti post-operatori e post-trapianto di organi, nei pazienti con gravi ustioni, insufficienza multiorgano e gravi traumi, per la diagnosi di sepsi a tutte le età, compresi i pazienti neutropenici, per la diagnosi differenziale tra meningite batterica e virale e per la diagnosi di artrite settica, per il rilevamento dell'interessamento renale nei bambini affetti da infezioni del tratto urinario.