Le paludisme est la maladie tropicale la plus redoutable au monde. Un enfant africain meurt de paludisme toutes les 30 secondes. La complexité spécifique du paludisme serait liée à une forte interaction du Plasmodium et de son vecteur avec l'environnement. Les cartes de distribution géographique montrent que la présence et l'impact du paludisme en santé publique varient considérablement avec le climat. L'éco-épidémiologie du paludisme au Sahara est encore mal connu. L'absence de pluies pendant des années peut entraîner une rupture prolongée de la transmission, comme les années 1970 à 1973, où le paludisme s'était retiré du sahel du fait de la sécheresse. Lorsqu'il pleut abondamment, la transmission sporadique peut se transformer rapidement en épidémies de paludisme qui surprennent de temps en temps la population faiblement ou non immunisée. Le sahel est caractérisé par une variabilité accrue du climat dont les bases sont encore mal cernées. L'effet majeur prévisible du changement climatique serait la transformation de tout le cycle de l'eau dont les manifestations importantes en Afrique seront les sécheresses et les inondations.